СЗГМУ им. И.И. Мечникова был образован в результате соединения двух старейших образовательных медицинских учреждений — Санкт-Петербургской медицинской академии последипломного образования и Санкт-Петербургской государственной медицинской академии им. И.И. Мечникова.
Основная задача университета сегодня — организация тесного взаимодействия образовательной, клинической и научно-исследовательской деятельности для подготовки профессиональных кадров.