В марте 2020-го года стартовал проект «Зеркальные лаборатории» – инициатива НИУ ВШЭ по внутрироссийским коллаборациям с учёными других вузов. Основной принцип проекта – равное участие обеих сторон, в первую очередь, финансовое. Кроме того, участники получают доступ к оборудованию, данным, методикам и научным результатам друг друга. Для студентов проект особенно интересен: привлечение к проекту воспитанников Вышки, молодых учёных и аспирантов является обязательной частью «Зеркальных лабораторий».
За пять лет было начато 41 научное исследование, а среди партнёров можно выделить Казанский федеральный университет, Южный федеральный университет, Новосибирский государственный педагогический университет и другие. В постоянном партнёрстве с ЮФУ и НГУ находятся Международная лаборатория квантовой оптоэлектроники и Центр исторических исследований. Результаты совместных работ публиковались во многих международных научных журналах, становились предметами обсуждений на конференциях и давали начало проектам студентов вузов по всей России: от воссоздания плана части города Старой Руссы до исследований полупроводниковых гетероструктур.